As variantes do SARS-CoV-2 repiten as mesmas mutacións segundo unha análise no Reino Unido
A situación de urxencia creada pola pandemia de COVID-19 puxo en marcha unha colaboración mundial masiva que recolleu e secuenció os xenomas de 13 millóns de mostras de SARS-CoV-2, unha cantidade de datos xenéticos moi superior á que se xerou ata entón.
Por Europa Press / Redacción | MADRID | 15/11/2022 | Actualizada ás 18:21
Unha análise de cantidades masivas de datos xenéticos sobre o virus do SARS-CoV-2 suxire que as variantes da COVID-19 en todo o mundo están a evolucionar repetidamente as mesmas mutacións.
O estudo, realizado por investigadores do Instituto Francis Crick (Reino Unido) e publicado na revista científica 'eLife', foi posible grazas a unha nova ferramenta web denominada Taxonium, que permite analizar cheas de datos recolleitos por científicos de todo o mundo para seguir a traxectoria xenética do virus. Así, pode ser utilizado polos científicos para seguir a evolución do SARS-CoV-2 e doutros virus ou organismos.
Os científicos levan moito tempo seguindo a evolución dos virus. Pero a situación de urxencia creada pola pandemia de COVID-19 puxo en marcha unha colaboración mundial masiva que recolleu e secuenció os xenomas de 13 millóns de mostras de SARS-CoV-2, unha cantidade de datos xenéticos moi superior á que se xerou ata entón. Con todo, a maioría das ferramentas existentes deseñadas para rastrexar a evolución viral non poden manexar esa cantidade de datos.
"Necesitabamos unha nova ferramenta que nos permitise explorar a árbore xenealóxica representado por estes millóns de secuencias do xenoma do SARS-CoV-2", afirmou o autor do estudo, Theo Sanderson.
Para axudar, Sanderson creou Taxonium, unha interface gratuíta baseada na web que permite aos científicos analizar as relacións xenéticas entre decenas de millóns de mostras de virus. Os científicos poden acceder aos datos e analizalos a través dun sitio web ou unha aplicación de escritorio.
Taxonium pode axudalos a buscar virus con mutacións xenéticas específicas, ou nun lugar concreto, e a ampliar as grandes árbores genealógicos dos virus para atopar a información que necesitan.
Sanderson asociouse con científicos da Universidade de California en Santa Cruz para crear unha versión de Taxonium específica para o SARS-CoV-2, denominada Cov2Tree, que organiza os datos dispoñibles publicamente sobre máis de seis millóns de secuencias do SARS-CoV-2 en árbores evolutivas.
Con esta ferramenta, o equipo rastrexou a evolución recente do virus do SRAS-CoV-2 e descubriu que moitas rexións separadas da árbore mostraban a adquisición de cambios similares na proteína 'spike' do virus. A análise suxire que as mesmas mutacións repítense en diferentes individuos de todo o mundo e persisten.
